在pcr儀上完成一個pcr反應所需要的時間決定于以下幾個因素：
1、模塊升溫和降溫時間
2、模塊與pcr管內(nèi)溫度平衡時間
3、延伸時間
4、循環(huán)次數(shù)
下面就以上幾點做一點分析，以便大家了解快速pcr技術與快速pcr儀的區(qū)別。
1、模塊升溫和降溫度時間
pcr儀一般會標明升溫速度和降溫速度，但標的大多是zui大變溫速度，也就是說是瞬間達到的速度。而與實驗相關的平均升降溫速度只有極少量廠家標明。以平均2度和4度（能做到平均升降溫4度的儀器極少）來計算，從95度降到55度，分別是20秒和10秒，每一個循環(huán)差20秒鐘。以一般35個循環(huán)來計算，影響實驗時間700秒，也就是不到12分鐘。實際還要考慮過沖問題，影響時間還會少些。
2、模塊與pcr管內(nèi)溫度平衡時間
模塊溫度達到后，pcr管內(nèi)的溫度遠沒有達到（塑料和水的導熱系數(shù)比鋁塊差300倍以上），需要時間來使二者達到平衡。一般有四種辦法來減少這一時間，一是讓模塊溫度過沖，在管內(nèi)溫度快達到時降到目標溫度，但太高的過沖可能造成實際溫度過沖，影響pcr反應結(jié)果；二是減少pcr反應液的體積，但體積變小時pcr反應的可靠性會降低；三是降低pcr管的厚度，但太薄時強度不夠；四是增加pcr管與模塊貼附程度。
3、延伸時間
延伸時間與pcr產(chǎn)物的長度和dna聚合酶的合成速度有關。如果pcr產(chǎn)物長度少于100bp時，可能考慮將延伸時間變?yōu)?（即兩步法）；采用高速的dna聚合酶也是常用的方法，但并不是所有pcr實驗都可以用高速的dna聚合酶。
4、循環(huán)次數(shù)
循環(huán)次數(shù)與模板量及檢測要求相關。
所謂快速pcr技術是將快速pcr儀與超薄管（或特殊貼附技術）以及高速dna聚合酶等技術整合在一起，可達到較短時間完成pcr反應。而一些廠家在向用戶推xiao pcr儀時，不去說明快速pcr技術，只強調(diào)pcr儀速度快（大都用升降溫速度來huyou用戶）。好像買了快速pcr儀后，原來1個半小時的擴增時間變會縮短成半小時似的。而用戶采購了快速pcr儀后才發(fā)現(xiàn)并不那么回事。有不少用戶采用快速模式根本就做不出好的實驗結(jié)果。特別是進行多重pcr擴增的用戶，系統(tǒng)用于身份鑒定的試劑。
快速pcr技術與快速pcr儀是兩回事。快速pcr儀只能縮短pcr反應時間10分鐘左右，要實現(xiàn)真正的快速pcr反應，還需要其他一些努力。大多數(shù)用戶根本就不需要快速pcr技術。

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