薄層色譜掃描儀是對薄層色譜進行定量檢測分析的儀器，當前市場上有兩類薄層色譜掃描儀：
傳統(tǒng)掃描儀
是一種全波長掃描儀，提供波長200-800nm范圍的可選波長，通過檢測樣品對光的吸收強弱確定物質含量。該掃描儀也能檢測254nm或365nm紫外照射產生的熒光強度，從而進行特異性檢測。
傳統(tǒng)掃描儀的掃描方式分為：單光束掃描、雙光束掃描和雙波長掃描。
單光束掃描：采用單一光束（即單一波長掃描），其結果就是上圖中一特定波長條件下的單條曲線。儀器結構簡單，但是基線不穩(wěn)，實際中很少使用。
雙光束掃描：采用同一波長的兩個光束同步掃描，一個光束掃描樣品展開通道，另一個光束掃描樣品通道旁邊的空白區(qū)域，這樣就可扣除空白吸收，部分消除薄層板展開方向鋪板不均勻產生的誤差。但是無法消除垂于展開方向鋪板不均勻產生的誤差。
雙波長掃描：兩個不同波長的光束交替掃描樣品展開的通道區(qū)域，波長選擇時，一個波長為樣品大吸收位置，另一是吸收極小值位置。這種方法可基本消除鋪板不均產生的誤差，因此掃描基線很穩(wěn)定。
以上各種掃描方式中，根據(jù)光源大小（掃描精度）不同可分為直線掃描和鋸齒掃描。
直線掃描：用可以覆蓋樣品展開通道的寬光束一次性掃完整個展開通道，即在展開方向上，每個點的數(shù)據(jù)只是一個掃描數(shù)據(jù)點。
薄層數(shù)碼成像分析儀
薄層數(shù)碼成像分析技術是利用數(shù)碼成像設備獲得薄層板上各點的光強度信息，之后對獲得圖像進行分析的薄層分析技術。數(shù)碼成像設備包括兩種：照相機和掃描儀（由于數(shù)碼掃描儀采用逐行成像技術，為便于區(qū)分傳統(tǒng)薄層掃描儀的逐點掃描，將數(shù)碼掃描儀稱為逐行掃描儀）。
和傳統(tǒng)薄層掃描一樣，照相機或逐行掃描儀都具有光檢測系統(tǒng)，它們都是將光量線性轉化為電信號的元件。不同的是，照相機和逐行掃描儀可進一步將電信號轉換成電腦圖像，圖像中單個點（像素）的顏色深淺反映了光的強弱。
因此，薄層數(shù)碼成像更接近人眼觀察檢測，結果更直觀，因此非常適合鑒別，特別是中藥指紋圖譜的識別。
數(shù)碼成像儀不僅能完成普通白光照射下的成像分析，再裝配254nm或365nm紫外燈后，也可以檢測特異熒光，特異熒光檢測。

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