q:我該如何得到wan美的多色結果呢?
a:首先,您需要有質量不錯的樣本和抗體,這就已經是成功的一半(樣本、抗體選擇攻略),對于樣本來說,脫片是我們需要預防的“頭號公敵”,多色實驗需要重復熱修復洗脫抗體多次,假如片子脫片,輕則成像模糊,重則組織脫落前功盡棄,可以在開始實驗之前先模擬幾輪熱修復,不加抗體和其他試劑,看看組織是否有脫落的跡象,如果脫落比較嚴重,則需要重新制備切片,如果有輕微脫片,則可以考慮購買抗體洗脫液(abs994),替代熱修復的過程;然后,就可以開始做實驗了,我們建議您先進行抗體和染料工作條件摸索,再上多染(參考下圖流程),這樣多染的成功率可以達到90%以上哦!(小愛經驗之談,即便是染了千百遍的常見指標,換個樣本,染色效果就可能天差地別,有條件還是建議要做預實驗)
最后的10%,就需要調整指標與染料搭配以及染色的順序了。
q:有沒有推薦的染料搭配和染色順序呢?
a:染料搭配一般遵循“寡靶配強光,眾靶配弱光”的原則,意思是表達比較弱的指標搭配熒光信號比較強的染料,表達相對強的指標搭配信號比較弱的染料,absin的tsa染料波長越短熒光強度越強,比如說需要染pd-1,cd8和cd3,我們手里有一個四色試劑盒(tsa520/tsa570/tsa650),通過ihc發現樣本中pd-1的信號很少,cd3信號非常多,其次是cd8,于是選擇tsa520搭配pd-1,tsa650搭配cd3,tsa570搭配cd8,比較合理。
接下來就是怎么安排染色先后順序:①劃分細胞定位,先外后內:確定每個指標的細胞定位,膜表達先染,胞漿或者胞核的后染(如果是指標比較多的情況下,胞內指標排在比較后面,經過前期多輪洗脫,可以不做細胞通透;如果指標很少,染胞內指標之前還是需要打孔,多個胞內指標也只需要打一次孔);②確定抗原修復方式,先酸后堿:堿修復比酸修復的力度會更強,個別抗體在用堿修復以后會染出來很多非特異性,所以如果是相同的細胞定位,就先染酸修復,再染堿修復的抗體;③根據ihc結果判別,先弱后強:組化結果顯示指標比較少,比較弱的,排在前面染,理論上來說越靠前染的指標效果會越接近單標染色。
以上就是一些通用規則,但不同的指標還是可能出現變化,要想得到wan美的結果,就需要不同的排列組合一個一個嘗試(如下表,“x”代表有信號),這樣會比較耗費時間和試劑,您可以根據通用規則先行一次多染,然后各通道跟熒光單染做對比,如果效果差別很大,那就再調整染色順序,如果單染的結果跟組化差別比較大(出現高背景,非特異性明顯),就要考慮更換染料搭配。
q:我成像完了以后想要做數據分析,你們有什么軟件推薦嗎?
a:目前市面上數據分析軟件還是比較多的,像免費的您可以下載imagej、qupath,缺點就是用法都需要您自行摸索;我們公司安裝的是halo和strataquest兩款軟件,halo是付費的,strataquest是我們tg的掃描儀平臺自帶的,從功能、分析的精準度和可操作性來說,肯定是大大優于開源軟件的,且有軟件專業的技術支持團隊能夠答疑解惑。您可以根據您的實際情況選擇合適的分析軟件,如果您實在無從下手,也可以找absin,我們可以提供數據分析的服務~
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absin病理抗體指標大全:
cd相關抗體:cd3、cd8a、cd4、cd68、cd206、cd163、cd20、cd19、cd45、cd56、cd10、cd117、cd138、cd14、cd146、cd15、cd1a、cd2、cd21、cd23、cd25、cd30、cd31、cd34、cd35、cd38、cd3g、cd44、cd5、cd7、cd79a、cd79b、cd99
角蛋白(ck)相關抗體:panck、ck-4、ck hmw、ck-1、ck-10、ck-14、ck-17、ck-18、ck-19、ck-20、ck-5、ck-5&6、ck-6、ck-7、ck-8、ck-8&18
癌癥腫瘤相關:p120、p16、p21、p40、p53、p63、afp、alk、amacr、anxa1、aurora-b、bcl-6、ctnnb1、ca125、cdk4、cdx2、cea、ccnd1、c-met、c-myc、dog1、cdh1、egfr、epcam、erg、ezh2、fabp3、fgfr2、foxp1、gata-3、gcdfp-15、gpc3、gzmb、her-2、idh1 r132h、ki-67、ldlr、mcm7、mcm3、mgmt、msh2、msh6、muc1、muc2、muc4、mum1、myod1、myogenin、myosin (smooth muscle)、napsin-a、n-cadherin、olig2、pax-2、pax-5、pax-8、pct、pd-1、phh3、plap、pmel-17、pdpn、pr、psa、psap、s100a1、s100p、sall4、satb1、sf-1、sox10、sox11、sox2、stat6、stathmin、tcl1、tfe3、tg、tle1、top2a、tpo、trps1、ttf-1、type i cytokeratins、type ii cytokeratins、uroplakin iii、villin、wt1、zap-70
神經相關:atrx、p75 ngf receptor、cga、ddx4、gfap、λlight chains、mbp、neun、neurofilament、nse、olig2、p75 ngf receptor、s100、syp
血管:ace2、vegf、vwf
鈣蛋白:calb1、caldesmon、calponin、calcitonin、calprotectin
其他:mpo、ar、arg-1、ar-v7、b2m、cldn1、collagen type ⅳ、col4a5、erα、gh、hbsag、hcg、hcg-beta、hpl、igd、igg、igm、igfbp3、insulin、oct3/4、scgn、somatostatin、tdt、actin、desmin
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