陽離子脂質分子在結構上由四個部分組成：一個或多個陽離子頭部（head）、連接鏈（spacer）、連接鍵（linker bond）和疏水烴尾（hydrophobic tail）。
脂質體/質粒復合體的結構和特性
質粒是表面帶負電荷的親水性大分子,具有的*電位,超螺旋 dna較線狀或有缺口的環狀dna有更高的負電荷密度,這些特征可阻止質粒通過完整的生物學屏障,脂質體與質粒結合后將改變質粒的一些性狀。脂質體/質粒復合體的組成及特性對脂質體的轉染活性有重要影響。
脂質體質粒復合體具有多種不同的構型,如線樣結構、囊泡樣結構、串珠形態等,至今還不能確定哪一種構型最有利于基因轉染。脂質體與質粒的不同比值對脂質體質粒復合體形態和結構有明顯影響。
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