液相色譜-質譜聯用儀是液相色譜與質譜聯用的儀器，主要用于分析gc/ms不能分析，或熱穩定性差，強極性和高分子量的物質，如生物樣品（藥物與其代謝產物）和生物大分子（肽、蛋白、核酸和多糖）。
液相色譜質譜聯用儀具有以下優點：
（1）廣適性檢測器，ms幾乎可以檢測所有的化合物，比較容易地解決了分析熱不穩定化合物的難題；
（2）分離能力強，即使在色譜上沒有*分離開，但通過ms的特征離子質量色譜圖也能分別畫出它們各自的色譜圖來進行定性定量，可以給出每一個組分的豐富的結構信息和分子量，并且定量結構十分可靠；
（3）檢測限低，ms具備高靈敏度，它可以在<10-12g水平下檢測樣品，通過選擇離子檢測方式，其檢測能力還可以提高一個數量級以上，特別是對于那些沒有=> 吸收的樣品，用12 檢測更是得心應手；
（4）可以讓科學家從分子水平上研究生命科學；
（5）質譜引導的自動純化，以質譜給餾分收集器提供觸發信號，可以大大提高制備系統的性能，克服了傳統uv制備中的很多問題。

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