一、流動相
gc用氣體作流動相，又叫載氣。常用的載氣有氦氣、氮氣和氫氣。與hplc相比，gc流動相的種類少，可選擇范圍小，載氣的主要作用是將樣品帶入gc系統(tǒng)進行分離，其本身對分離結(jié)果的影響很有限。而在hplc中，流動相種類多，且對分離結(jié)果的貢獻很大。換一個角度看，gc的操作參數(shù)優(yōu)化相對hplc要簡單一些。此外，gc載氣的成本要低于hplc流動相的成本。
二、固定相
因為gc的載氣種類相對少，故其分離選擇性主要通過不同的固定相來改變，尤其在填充柱gc中，固定相常由載體和涂敷在其表面的固定液組成，這對分離有決定性的影響，所以，導(dǎo)致了種類繁多的gc固定相的開發(fā)研究。迄今已有數(shù)百種gc固定相可供我們選擇使用，但常用的hplc固定相也就十幾種。故lc在很大程度上要靠選用不同的流動相來改變分離選擇性。當(dāng)然，毛細管gc常用的固定相也不過十幾種。在實際分析中，gc一般是選用一種載氣，然后通過改變色譜柱（即固定相）以及操作參數(shù)（柱溫和載氣流速等）來優(yōu)化分離，而lc則往往是選定色譜柱后，通過改變流動相的種類和組成以及操作參數(shù)（柱溫和流動相流速等）來優(yōu)化分離。
三、分析對象
gc所能直接分離的樣品是可揮發(fā)、且熱穩(wěn)定的，沸點一般不超過500℃。據(jù)有關(guān)資料統(tǒng)計，在目前已知的化合物中，有20%～25%可用gc直接分析，其余原則上均可用lc分析。也就是說gc的分析對象遠沒有l(wèi)c多。需要指出的是，有些雖然不能用gc直接分析的樣品，通過特殊的進樣技術(shù)，如頂空進樣和裂解進樣，也可用gc間接分析。比如高分子材料的裂解色譜就是如此。這在一定程度上擴大了gc分析對象的范圍。此外，gc比lc更適合于氣體的分析。
四、檢測技術(shù)
gc常用的檢測技術(shù)有多種，比如熱導(dǎo)檢測器（tcd）、火焰離子化檢測器（fid）、電子俘獲檢測器（ecd）、氮磷檢測器（npd）等，其中fid對大部分有機化合物均有響應(yīng)，且靈敏度相當(dāng)高，小檢測限可達納克級。而在lc中尚無通用性這么好的高靈敏度檢測器。商品lc儀器常配的也就是紫外-可見光吸收檢測器（uv-vis）和示差折光檢測器（ri）。前者的通用性遠不及gc中的fid，后者的靈敏度又較低，且不適于梯度洗脫。當(dāng)然，不論gc還是lc，都有一些高靈敏度的選擇性檢測器，gc有ecd和npd等，lc有熒光和電化學(xué)檢測器。較為理想的檢測器應(yīng)該*ms，但在這一點上，gc目前要優(yōu)于lc。因為gc流動相的特點，它與ms的在線聯(lián)用已不存在任何問題，特別是毛細管gc與ms的聯(lián)用已成為常規(guī)分析方法。而lc與ms的聯(lián)用就受到了流動相的限制。雖然目前已有多種接口，如離子束、熱噴霧、電噴霧等，但流動相的選擇還是受到明顯的限制。
五、制備分離
在新產(chǎn)品的研究開發(fā)過程中，或在未知物的定性鑒定工作中，常需要收集色譜分離后的組分作進一步分析，而某些高純度的生化試劑則是直接用色譜分離來制備的。就這一點而言，gc在原理上應(yīng)該是有優(yōu)勢的，因為收集餾分后載氣很容易除去。然而，由于gc的柱容量遠不及l(fā)c，如果用gc作制備，那是相當(dāng)費時的。因此，制備gc的實用價值很有限。制備lc則有很廣泛的應(yīng)用。

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